Fasilitas penting dari terminal baru Bandara Sepinggan adalah 11 unit garbarata, terowongan yang mengantar penumpang langsung ke pintu pesawat, atau sebaliknya langsung keluar ke gedung terminal. Sebelumnya ada 74 check-in-counter yang dipasangkan dengan 8 unit ban berjalan (conveyor belt) untuk mengantar bagasi ke pesawat. Bagasi juga ditangani dengan sistem terbaru, yaitu HBS (hold baggage screening) level 4. Di depan terminal ada gedung parkir yang mampu menampung 2.300 mobil. Sehingga membuat Bandara Sepinggan menjadi bandara terbesar di Kawasan Timur Indonesia.
